Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppp6r1Q7TSI3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp6r1Q7TSI3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp6r1Q7TSI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppp6r1Q7TSI3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp6r1Q7TSI3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp6r1Q7TSI3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp6r1Q7TSI3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms