Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnf1Q7TSH7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnf1Q7TSH7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnf1Q7TSH7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnf1Q7TSH7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnf1Q7TSH7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms