Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf139Q7TMV1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf139Q7TMV1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf139Q7TMV1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf139Q7TMV1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms