Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb2aQ7TMM9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb2aQ7TMM9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms