Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SyncripQ7TMK9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncripQ7TMK9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SyncripQ7TMK9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms