Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sned1Q70E20 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sned1Q70E20 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sned1Q70E20 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sned1Q70E20 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms