Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syne2Q6ZWQ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Syne2Q6ZWQ0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Syne2Q6ZWQ0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms