Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp34Q6ZQ93 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp34Q6ZQ93 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp34Q6ZQ93 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp34Q6ZQ93 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp34Q6ZQ93 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms