Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc44a1Q6X893 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc44a1Q6X893 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc44a1Q6X893 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc44a1Q6X893 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms