Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfrkbQ6PIJ4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfrkbQ6PIJ4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfrkbQ6PIJ4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms