Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cacna2d2Q6PHS9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d2Q6PHS9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d2Q6PHS9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna2d2Q6PHS9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms