Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx13Q6PHS6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx13Q6PHS6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx13Q6PHS6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx13Q6PHS6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms