Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc57Q6PHN1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc57Q6PHN1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc57Q6PHN1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms