Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc36Q6PDM4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc36Q6PDM4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc36Q6PDM4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms