Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc117Q6PB51 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc117Q6PB51 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc117Q6PB51 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc117Q6PB51 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms