Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Herc4Q6PAV2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Herc4Q6PAV2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Herc4Q6PAV2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms