Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atl2Q6PA06 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atl2Q6PA06 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl2Q6PA06 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms