Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp49Q6P9L4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp49Q6P9L4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp49Q6P9L4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp49Q6P9L4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp49Q6P9L4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms