Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hdac10Q6P3E7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac10Q6P3E7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac10Q6P3E7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac10Q6P3E7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms