Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtl3Q6P1Y1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rtl3Q6P1Y1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtl3Q6P1Y1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtl3Q6P1Y1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms