Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac4Q6NZM9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac4Q6NZM9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hdac4Q6NZM9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms