Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Soga3Q6NZL0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga3Q6NZL0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Soga3Q6NZL0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Soga3Q6NZL0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Soga3Q6NZL0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms