Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tvp23aQ6NVH0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tvp23aQ6NVH0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tvp23aQ6NVH0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.1 ms