Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2810408A11RikQ6NSU2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
2810408A11RikQ6NSU2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2810408A11RikQ6NSU2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2810408A11RikQ6NSU2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms