Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KdsrQ6GV12 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KdsrQ6GV12 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KdsrQ6GV12 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms