Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lemd2Q6DVA0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lemd2Q6DVA0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lemd2Q6DVA0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lemd2Q6DVA0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms