Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zcchc2Q69ZB8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zcchc2Q69ZB8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms