Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntn4Q69Z26 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cntn4Q69Z26 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cntn4Q69Z26 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn4Q69Z26 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms