Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab3ipQ68EF0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab3ipQ68EF0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab3ipQ68EF0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab3ipQ68EF0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab3ipQ68EF0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab3ipQ68EF0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab3ipQ68EF0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab3ipQ68EF0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab3ipQ68EF0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab3ipQ68EF0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab3ipQ68EF0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab3ipQ68EF0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms