Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CilpQ66K08 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CilpQ66K08 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CilpQ66K08 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms