Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnna3Q65CL1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctnna3Q65CL1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnna3Q65CL1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms