Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprcapQ64697 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprcapQ64697 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprcapQ64697 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprcapQ64697 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprcapQ64697 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprcapQ64697 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
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PtprcapQ64697 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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PtprcapQ64697 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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PtprcapQ64697 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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PtprcapQ64697 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprcapQ64697 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
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PtprcapQ64697 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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PtprcapQ64697 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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PtprcapQ64697 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprcapQ64697 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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PtprcapQ64697 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprcapQ64697 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprcapQ64697 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprcapQ64697 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprcapQ64697 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprcapQ64697 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprcapQ64697 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprcapQ64697 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprcapQ64697 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprcapQ64697 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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