Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ccdc18Q640L5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc18Q640L5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ccdc18Q640L5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ccdc18Q640L5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ccdc18Q640L5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
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