Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PatjQ63ZW7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PatjQ63ZW7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PatjQ63ZW7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PatjQ63ZW7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms