Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd33Q63994 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd33Q63994 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd33Q63994 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms