Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2kQ63871 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2kQ63871 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms