Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Vil1Q62468 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vil1Q62468 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vil1Q62468 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vil1Q62468 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vil1Q62468 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vil1Q62468 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vil1Q62468 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vil1Q62468 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vil1Q62468 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vil1Q62468 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vil1Q62468 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vil1Q62468 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vil1Q62468 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vil1Q62468 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 317.3 ms