Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vamp1Q62442 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp1Q62442 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp1Q62442 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms