Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccl12Q62401 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl12Q62401 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms