Protein–RNA interactions for Protein: Q62398

Cnga2, Cyclic nucleotide-gated olfactory channel, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga2Q62398 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga2Q62398 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnga2Q62398 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnga2Q62398 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cnga2Q62398 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnga2Q62398 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnga2Q62398 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms