Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Ss18Q62280 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ss18Q62280 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ss18Q62280 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ss18Q62280 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ss18Q62280 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ss18Q62280 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ss18Q62280 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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