Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SypQ62277 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SypQ62277 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SypQ62277 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SypQ62277 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SypQ62277 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SypQ62277 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SypQ62277 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SypQ62277 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SypQ62277 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SypQ62277 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SypQ62277 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SypQ62277 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SypQ62277 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SypQ62277 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SypQ62277 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SypQ62277 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SypQ62277 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SypQ62277 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SypQ62277 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SypQ62277 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SypQ62277 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SypQ62277 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SypQ62277 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SypQ62277 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SypQ62277 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SypQ62277 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SypQ62277 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SypQ62277 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SypQ62277 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SypQ62277 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SypQ62277 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SypQ62277 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SypQ62277 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SypQ62277 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SypQ62277 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SypQ62277 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SypQ62277 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SypQ62277 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SypQ62277 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SypQ62277 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SypQ62277 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SypQ62277 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SypQ62277 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SypQ62277 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SypQ62277 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SypQ62277 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SypQ62277 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SypQ62277 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SypQ62277 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SypQ62277 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SypQ62277 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SypQ62277 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SypQ62277 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SypQ62277 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SypQ62277 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SypQ62277 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SypQ62277 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SypQ62277 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SypQ62277 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SypQ62277 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SypQ62277 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SypQ62277 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SypQ62277 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SypQ62277 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SypQ62277 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SypQ62277 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SypQ62277 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SypQ62277 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SypQ62277 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SypQ62277 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SypQ62277 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SypQ62277 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SypQ62277 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SypQ62277 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SypQ62277 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SypQ62277 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SypQ62277 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SypQ62277 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SypQ62277 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SypQ62277 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SypQ62277 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SypQ62277 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SypQ62277 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SypQ62277 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SypQ62277 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SypQ62277 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SypQ62277 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SypQ62277 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SypQ62277 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SypQ62277 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SypQ62277 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SypQ62277 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SypQ62277 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SypQ62277 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SypQ62277 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SypQ62277 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SypQ62277 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SypQ62277 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SypQ62277 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms