Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Six2Q62232 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Six2Q62232 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Six2Q62232 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Six2Q62232 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Six2Q62232 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Six2Q62232 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six2Q62232 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six2Q62232 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Six2Q62232 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six2Q62232 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six2Q62232 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six2Q62232 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six2Q62232 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six2Q62232 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Six2Q62232 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Six2Q62232 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six2Q62232 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms