Protein–RNA interactions for Protein: Q62230

Siglec1, Sialoadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siglec1Q62230 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Siglec1Q62230 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Siglec1Q62230 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Siglec1Q62230 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Siglec1Q62230 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Siglec1Q62230 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Siglec1Q62230 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Siglec1Q62230 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Siglec1Q62230 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Siglec1Q62230 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Siglec1Q62230 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Siglec1Q62230 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Siglec1Q62230 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Siglec1Q62230 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Siglec1Q62230 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Siglec1Q62230 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Siglec1Q62230 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Siglec1Q62230 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Siglec1Q62230 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Siglec1Q62230 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Siglec1Q62230 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms