Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SnrpaQ62189 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SnrpaQ62189 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SnrpaQ62189 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnrpaQ62189 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms