Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt33bQ61897 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt33bQ61897 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt33bQ61897 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms