Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LbpQ61805 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LbpQ61805 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LbpQ61805 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LbpQ61805 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LbpQ61805 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LbpQ61805 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LbpQ61805 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LbpQ61805 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LbpQ61805 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LbpQ61805 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LbpQ61805 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LbpQ61805 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LbpQ61805 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LbpQ61805 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LbpQ61805 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LbpQ61805 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LbpQ61805 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms