Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga7Q61738 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itga7Q61738 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itga7Q61738 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itga7Q61738 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga7Q61738 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga7Q61738 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga7Q61738 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms