Protein–RNA interactions for Protein: Q61666

Hira, Protein HIRA, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HiraQ61666 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HiraQ61666 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HiraQ61666 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HiraQ61666 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HiraQ61666 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HiraQ61666 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HiraQ61666 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HiraQ61666 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HiraQ61666 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HiraQ61666 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HiraQ61666 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HiraQ61666 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HiraQ61666 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HiraQ61666 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms