Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tsg101Q61187 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tsg101Q61187 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tsg101Q61187 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms